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Las expansiones de repeticiones son variaciones genéticas comunes que están frecuentemente asociadas a enfermedades neurogenéticas. Estos tipos de mutaciones son dinámicas e inestables y su número de repeticiones puede cambiar de generación en generación.
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Las condiciones que están causadas por expansiones de repeticiones son heterogéneas tanto clínica como genéticamente y varían en función de la secuencia de la repetición, su tamaño y localización dentro del gen y si la repetición se traduce a proteína.
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El análisis del tamaño de la repetición mediante PCR es el método más coste-eficaz para el diagnóstico de enfermedades asociadas a las expansiones de repeticiones.
EXP– Expansión de repeticiones
El análisis de expansiones está indicado para:
- Diagnóstico de pacientes con sospecha clínica de una enfermedad genética que puede estar causada por una mutación de expansión de repeticiones
- Estudio de portadores de expansiones asociadas a enfermedades autosómicas recesivas o ligadas al cromosoma X
- Diagnóstico presintomático de familiares de alto riesgo de padecer una enfermedad de inicio tardío causada por expansiones
Algunas de las enfermedades genéticas más comunes causadas por expansiones son:
- Síndrome de X frágil y otros síndromes relacionados
- Ataxia de Friedreich
- Enfermedad de Huntington
- Distrofia Miotónica tipo 1 y 2
- Ataxias espinocerebelosas
Distintos tipos de análisis por PCR pueden realizarse en función de la enfermedad de estudio:
- Amplificación mediante PCR de la expansión cuando la enfermedad está causada por un pequeño número de repeticiones (< 50 repeticiones)
- TP-PCR, (triplet repeat primed PCR) cuando la enfermedad está causada por un gran número de repeticiones (>100 repeticiones) que la PCR convencional no puede amplificar. Los primers de amplificación engloban la repetición de estudio además de la propia repetición.
Resultados e informes
El número de repeticiones, los rangos clínicos de tamaño y los patrones de herencia varían de una enfermedad a otra.
- Alelos normales
Los alelos con un número de repeticiones correspondientes al rango normal para cada enfermedad no son patogénicos y el paciente no tiene riesgo de desarrollar la enfermedad en función de su modo de herencia.
- Alelos Premutados
Los alelos con un número de repeticiones correspondientes al rango de premutación no son, normalmente, patogénicos, pero esos alelos suelen ser inestables y pueden expandirse a una mutación completa in las siguientes generaciones.
Dependiendo de la enfermedad y modo de herencia, algunos individuos con premutación puede desarrollar síntomas de la enfermedad.
- Mutación completa
Los alelos con un número de repeticiones correspondientes al rango de mutación completa son patogénicos y su detección es diagnóstica de la enfermedad, dependiendo de la enfermedad y su modo de herencia. La edad de inicio y la gravedad de los síntomas pueden variar en función del número de repeticiones.
Requisitos de muestras
En los casos prenatales:
- Es altamente recomendable el contacto previo con el laboratorio y la planificación de los tiempos para evitar posibles incidencias con los plazos prenatales
- Se requiere muestra de sangre materna junto con las correspondientes muestras prenatales obtenidas mediante líquido amniótico, biopsia corial o restos fetales con el objetivo de descartar una posible contaminación de la muestra fetal con muestra materna
- Otras muestras familiares pueden ser solicitadas como controles positivos
- Todos los casos prenatales son procesados con la máxima prioridad
Se requiere un adecuado etiquetado de los tubos con la información necesaria del paciente que permita su identificación inequívoca. Un etiquetado incorrecto puede implicar un rechazo de la muestra. La información mínima requerida para identificar y aceptar una muestra es: nombre completo del paciente, fecha de nacimiento, sexo y número de registro médico.
El formulario solicitud y el correspondiente consentimiento informado deben estar debidamente cumplimentados y firmados por el paciente y médico prescriptor.
Limitaciones
- El objetivo de este estudio se limita al análisis de la expansión concreta del gen/enfermedad de interés.
- En el caso de grandes expansiones es posible no poder obtener el número exacto de repeticiones.
- La secuenciación del gen o el análisis de deleciones/duplicaciones no está incluido en el presente análisis, aunque puede solicitarse a parte.
- Este análisis no incluye estudios de metilación